Đến nay, Trung tâm Theo dõi phản ứng có hại của New Zealand (CARM) đã nhận được 22 báo cáo về các phản ứng bất lợi bị nghi ngờ là do montelukast. Hơn một nửa số báo cáo này mô tả các biến cố tâm thần kinh. Các phản ứng tâm thần kinh thường được ghi nhận là giấc mơ bất thường, mất ngủ và hung tính. Đáng lưu ý là trong một số báo cáo, bệnh nhân cũng sử dụng corticosteroid. Tuy nhiên, trong một số trường hợp khác, montelukast là thuốc duy nhất được ghi nhận. Các phản ứng tâm thần kinh đã được ghi nhận: kích động (bao gồm hành vi hung hăng hoặc thù địch); lo lắng; trầm cảm; mất phương hướng; mất chú ý; giấc mơ bất thường; ảo giác; mất ngủ; suy giảm trí nhớ; tăng động tâm vận động (bao gồm khó chịu, bồn chồn và run); buồn ngủ; có ý nghĩ và hành vi tự tử khi sử dụng montelukast.
Để tránh gặp phải các biến cố bất lợi này cho người sử dụng thuốc, đặc biệt là trẻ em, Trung tâm Theo dõi phản ứng có hại của New Zealand khuyến cáo các bác sĩ nên cân nhắc kỹ giữa lợi ích và nguy cơ khi kê đơn sử dụng thuốc này, cũng như cần trao đổi với bệnh nhân và người nhà bệnh nhân được biết các biến cố có thể xảy ra khi sử dụng thuốc. Về phía người bệnh cần theo dõi trong quá trình dùng montelukast, nếu thấy xuất hiện bất cứ dấu hiệu nào khác thường cần ngừng ngay thuốc, thông báo kịp thời cho bác sĩ điều trị và đến ngay cơ sở y tế để có hướng xử trí phù hợp.