Chỉ thị nêu rõ: Trước tình hình biến đổi khí hậu khiến thiên tai ngày càng diễn biến bất thường, cực đoan, khó dự báo, Thủ tướng yêu cầu UBND các địa phương tuyệt đối không để xảy ra gián đoạn trong lãnh đạo, chỉ đạo ứng phó và khắc phục hậu quả thiên tai trong quá trình thực hiện sáp nhập cấp tỉnh và tổ chức chính quyền địa phương 2 cấp.
Đặc biệt, không được để bị động, bất ngờ; không để gián đoạn chỉ đạo, điều hành trong bối cảnh sắp xếp, tinh gọn bộ máy hệ thống chính trị, sắp xếp lại đơn vị hành chính và đẩy mạnh phân cấp, phân quyền cho địa phương.

Thủ tướng giao Chủ tịch UBND các tỉnh, thành phố tập trung rà soát, cập nhật phương án ứng phó với từng loại hình thiên tai phù hợp với tình hình mới. Trong đó, cần triển khai quyết liệt các biện pháp bảo đảm an toàn tính mạng cho Nhân dân, đặc biệt là giảm thiểu thiệt hại về người do sạt lở đất, lũ quét, lũ và bão lớn; xây dựng kịch bản sẵn sàng ứng phó, bảo vệ các trọng điểm xung yếu, không để bị động khi có thiên tai xảy ra.
Thủ tướng giao Bộ trưởng Bộ NN&MT theo dõi, giám sát chặt chẽ tình hình thời tiết, thiên tai để kịp thời dự báo, cảnh báo, cung cấp thông tin cho cơ quan chức năng và người dân chủ động triển khai ứng phó, giảm thiểu thiệt hại.
Đồng thời, chủ động chỉ đạo, tổ chức thực hiện công tác phòng, chống và khắc phục hậu quả thiên tai theo chức năng, nhiệm vụ và thẩm quyền được giao. Hướng dẫn, kiểm tra, đôn đốc các địa phương rà soát, cập nhật, hoàn thiện phương án phòng, chống thiên tai, đặc biệt chú trọng đến việc bảo đảm phương châm "bốn tại chỗ" phù hợp với điều kiện cụ thể tại địa phương và cơ cấu tổ chức chính quyền 2 cấp.
Bộ trưởng Bộ Công Thương được giao chỉ đạo công tác bảo đảm an toàn hồ đập thủy điện, hệ thống truyền tải và cung cấp điện trong mùa mưa bão; phối hợp với Bộ NN&MT để điều hành vận hành an toàn hồ chứa, sử dụng hiệu quả nguồn nước.
Bộ trưởng Bộ Xây dựng chỉ đạo các đơn vị liên quan và địa phương rà soát, thực hiện các biện pháp bảo đảm an toàn cho các công trình hạ tầng giao thông, xây dựng, nhất là hệ thống tiêu thoát nước tại các tuyến giao thông trọng điểm và đô thị lớn (như Đà Nẵng, Đà Lạt, Phú Quốc…) nhằm chủ động tiêu thoát nước, khắc phục tình trạng ngập úng khi mưa lớn. Đồng thời, triển khai các biện pháp bảo đảm an toàn giao thông, kịp thời khắc phục sự cố sạt lở, chia cắt, tránh gây ách tắc trên các tuyến giao thông huyết mạch.
Bộ trưởng Bộ Quốc phòng chủ trì, phối hợp với các cơ quan liên quan khẩn trương hoàn thiện, trình cấp có thẩm quyền ban hành Nghị định hướng dẫn thi hành một số điều của Luật Phòng thủ dân sự; đồng thời rà soát, xây dựng phương án sẵn sàng huy động lực lượng, phương tiện hỗ trợ địa phương trong công tác ứng phó, khắc phục hậu quả thiên tai và thực hiện cứu hộ, cứu nạn theo quy định.
Bộ trưởng Bộ Công an chỉ đạo công an các địa phương, đặc biệt là lực lượng công an cơ sở, xây dựng kế hoạch và chủ động triển khai lực lượng, phương tiện hỗ trợ Nhân dân trong phòng, chống và khắc phục hậu quả thiên tai, tìm kiếm cứu nạn khi có tình huống xảy ra...