Với vai trò là cơ quan đầu não của ngành y tế, với chức năng quản lý Nhà nước về chăm sóc và bảo vệ sức khỏe nhân dân, trong suốt nhiều thập kỷ qua, Đảng bộ cơ quan Bộ Y tế- nay là Đảng bộ Bộ Y tế đã cùng toàn thể cán bộ, công chức, viên chức trong cơ quan Bộ luôn ra sức phát huy truyền thống vẻ vang của Đảng, của dân tộc, nỗ lực phấn đấu, thực hiện thắng lợi các nhiệm vụ chính trị mà Đảng và Nhà nước giao cho.
Năm 2009, Đảng bộ và cán bộ, công chức, viên chức trong cơ quan Bộ đã cùng với toàn ngành y tế phấn đấu đạt được nhiều thành tựu đáng khích lệ, mặc dù còn không ít khó khăn, thách thức đòi hỏi phải nỗ lực phấn đấu vượt qua trong những năm tiếp theo. Bằng những nỗ lực, năm 2009, toàn ngành y tế đã có những tiến bộ vượt bậc, với việc hoàn thành xuất sắc 4/4 chỉ tiêu Quốc hội giao và 15/15 chỉ tiêu của ngành. Một số chỉ tiêu thiên niên kỷ, ngành y tế đã đạt và vượt trước thời hạn từ 2 đến 5 năm. Hệ thống y tế cơ sở ngày càng củng cố và phát triển, 100% số xã và 90% số thôn bản đã có cán bộ y tế hoạt động, trên 70% số xã thực hiện khám chữa bệnh ban đầu cho người có thẻ Bảo hiểm y tế; Kiểm soát chặt chẽ dịch cúm A H1N1, dịch tiêu chảy cấp nguy hiểm, hạn chế tối đa các trường hợp mắc và tử vong; kiểm soát dịch sốt xuất huyết, giảm tỷ lệ mắc và chết so với cùng kỳ năm 2008; các dịch bệnh khác đều được kiểm soát, khống chế. Công tác quản lý nhà nước cũng được chú trọng. Đặc biệt là xây dựng văn bản quy phạm pháp luật, tổ chức triển khai, giám sát; tăng cường công tác thanh, kiểm tra và giám sát thực hiện, tăng cường hiệu quả hoạt động của ngành.
Hệ thống bệnh viện được củng cố và phát triển bằng nhiều nguồn vốn; đạt 27 giường bệnh/vạn dân (bao gồm bệnh viện công lập, bệnh viện tư nhân và trạm y tế xã); giảm tỷ lệ quá tải bệnh viện so với năm 2008. Công tác giám định pháp y, giám định y khoa, công tác đào tạo nghiên cứu khoa học, áp dụng kỹ thuật mới, kỹ thuật cao đã và đang được sử dụng có hiệu quả...