Phục hồi di chứng của viêm não Nhật Bản (VNNB) luôn là một vấn đề nan giải. Ở giai đoạn viêm não cấp tính, y học cổ truyền (YHCT) chỉ có thể hỗ trợ điều trị. Ở giai đoạn sau, nhất là giai đoạn bán cấp, điều trị bằng phương pháp châm cứu xoa bóp của YHCT lại là phương pháp điều trị phục hồi chức năng chủ yếu có kết quả tốt. Điều quan trọng là quá trình điều trị có thể kéo dài đến 3 - 4 năm hoặc lâu hơn nữa, vì thế cần giải thích cặn kẽ cho gia đình người bệnh để cùng phối hợp điều trị trong quá trình điều trị phục hồi di chứng một cách tốt nhất.
YHCT không có bệnh danh cho bệnh VNNB. Tuy nhiên khi so sánh đối chiếu với những mô tả trong y văn kinh điển của YHCT, thấy bệnh thuộc phạm vi các bệnh ôn nhiệt, dịch lệ của YHCT. Bệnh thường phát vào mùa hè nên thuộc thử ôn.
Thử ôn (nắng nóng) là thứ nhiệt cực thịnh, gây sốt cao và tổn thương tân dịch rất mạnh. Bệnh tà qua nhanh phần vệ khí, vào phần huyết, làm can huyết hư sinh phong, gây co giật, hàm răng nghiến chặt, gọi là thử phong hay thử kinh. Nhiệt nhập tâm bào, bế tâm khiếu, sinh hôn mê. Nhiệt cực sinh hàn, làm chân tay giá lạnh, tuy thân mình vẫn nóng (nhiệt thâm quyết thâm), gọi là thử quyết.