Theo đó, Khu kinh tế Vân Phong (nằm trên địa phận Ninh Hòa và Vạn Ninh, Khánh Hòa) là khu kinh tế tổng hợp đa ngành, đa lĩnh vực có vai trò đầu tàu thu hút đầu tư và là động lực phát triển kinh tế cho các vùng lân cận và cho cả nước.
Trong đó kinh tế biển là nền tảng, trong khu kinh tế có cảng trung chuyển container quốc tế và dịch vụ logistic, đô thị, dịch vụ, du lịch, công nghiệp giữ vai trò quan trọng.
Là trung tâm dịch vụ du lịch và vui chơi giải trí tổng hợp cao cấp, Khu kinh tế Vân Phong sẽ là đô thị thông minh bền vững với hệ thống cơ sở hạ tầng kinh tế - xã hội phát triển đồng bộ, hiện đại.
Định hướng quy hoạch xây dựng Khu kinh tế Vân Phong đến năm 2040, tầm nhìn đến năm 2050 sẽ có 19 phân khu.
Cụ thể, khu vực bán đảo Hòn Gốm, đảo Hòn Lớn có tổng diện tích đất tự nhiên khoảng 14.756 ha gồm 5 phân khu: Khu du lịch sinh thái đảo Hòn Lớn; Khu du lịch núi Khải Lương; Trung tâm cảng biển - đô thị Đầm Môn; Khu đô thị, du lịch Vĩnh Yên - mũi Đá Son; Khu đô thị, thương mại, dịch vụ du lịch Tuần Lễ - Hòn Ngang.
Khu vực Cổ Mã - Tu Bông có tổng diện tích đất tự nhiên khoảng 16.589 ha gồm 4 phân khu: Khu du lịch đảo Điệp Sơn; Khu đô thị sinh thái Đại Lãnh; Khu đô thị, du lịch Cổ Mã - Tu Bông; Khu du lịch sinh thái núi Tây Tu Bông.
Khu vực Vạn Giã và vùng phụ cận có tổng diện tích đất tự nhiên khoảng 24.229 ha gồm 4 phân khu: Khu sinh thái núi Tây Vạn Giã; Khu đô thị Vạn Giã và vùng phụ cận; Khu đô thị Nam Vạn Giã; Khu công nghiệp, đô thị dịch vụ Vạn Hưng.
Khu vực Đông - Bắc Ninh Hòa có tổng diện tích đất tự nhiên khoảng 7.021 ha gồm 3 phân khu: Khu đô thị du lịch Ninh Hải - Dốc Lết; Khu dịch vụ đô thị, công nghiệp Tây Ninh An; Khu dịch vụ đô thị và dân cư đông Bắc Ninh Hòa.
Khu vực Đông - Nam Ninh Hòa có tổng diện tích đất tự nhiên khoảng 12.373 ha gồm 3 phân khu: Khu đô thị và công nghiệp Bắc Hòn Hèo; Khu đô thị dịch vụ trung tâm Ninh Hòa; Khu chức năng công nghiệp và cảng biển Nam Vân Phong.
Đến năm 2030, quy mô dân số Khu kinh tế Vân Phong khoảng 350.000-380.000 người, đến năm 2040 khoảng 420.000 - 450.000 người.