Căn cứ kết quả điều tra và tài liệu, chứng cứ thu thập được, xác định: Trương Thanh Phong, nguyên Tổng Giám đốc; Trần Văn Vẹn, nguyên Chủ tịch HĐQT; Trần Bảy, nguyên Trưởng Phòng kế hoạch chiến lược VINAFOOD II đã có hành vi vi phạm pháp luật trong việc quản lý, sử dụng khu đất diện tích 7.619,8 m2 tại địa chỉ 132 Bến Vân Đồn, phường 6, quận 4, Thành phố Hồ Chí Minh, gây thiệt hại đặc biệt nghiêm trọng cho Nhà nước.
Ngày 28/6, Cơ quan Cảnh sát điều tra (Bộ Công an) ra Quyết định khởi tố vụ án hình sự, khởi tố bị can, bắt tạm giam, khám xét đối với 3 cá nhân trên về tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí" theo khoản 3 Điều 219 Bộ luật Hình sự năm 2015, sửa đổi, bổ sung năm 2017.
Sau khi Viện kiểm sát nhân dân tối cao đã phê chuẩn, Cơ quan Cảnh sát điều tra (Bộ Công an) đã thi hành các Quyết định, Lệnh nêu trên theo đúng quy định pháp luật.
Hiện, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đang tập trung điều tra mở rộng vụ án và áp dụng các biện pháp theo luật định để thu hồi tài sản thất thoát cho Nhà nước.