Để đảm bảo đủ nước sinh hoạt và không để các dịch bệnh phát sinh sau lũ, ngay sau khi nước rút Trung tâm Y tế dự tỉnh phối hợp trung tâm y tế dự phòng các huyện, thị xã, thành phố và chính quyền địa phương cùng với cán bộ các trạm y tế xã xuống tận nhà dân kiểm tra công tác vệ sinh môi trường, xử lý nguồn nước và phun hóa chất phòng chống sốt xuất huyết, tiêu độc vệ sinh môi trường. Đồng thời tổ chức phân cấp lượng thuốc, hóa chất xử lý nguồn nước sinh hoạt tại các hộ gia đình bị ngập giếng với số lượng 283kg Cloramin B bột, hơn 100.000 Cloramin B và Aquatab, 250kg phèn chua cùng 10 cơ số thuốc phòng chống lụt bão cấp cho các địa phương bị ngập nặng.
Cán bộ ngành y tế Hà Tĩnh đến từng nhà dân hướng dẫn xử lý giếng nước bị ngập trong lũ.
Trung tâm Truyền thông - Giáo dục sức khỏe đầy mạnh công tác tuyên truyền về vệ sinh sinh cá nhân, vệ sinh môi trường, phòng chống muỗi, côn trùng đốt gây ra các bệnh dịch nguy hiểm, vận động nhân dân thực hiện tốt công tác ATVSTP: ăn chín uống sôi, sử dụng nguồn nước sạch..
Đến nay, ngành y tế cơ bản đã xử lý xong giếng nước sinh hoạt, công trình vệ sinh và môi trường cho bà con nhân dân trên địa bàn, các dịch bệnh cơ bản được không chế.