Bên cạnh đó, có 2 khoản phí ban hành mức thu mới thay cho mức thu cũ do có sự thay đổi về chính sách, bao gồm: phí bảo vệ môi trường đối với khai thác khoáng sản và phí đấu giá, phí tham gia đấu giá tài sản.
Về phí bảo vệ môi trường đối với khai thác khoáng sản, căn cứ thực trạng nguồn tài nguyên khoáng sản trên địa bàn Hà Nội không dồi dào, việc khai thác cần đảm bảo hiệu quả, tiết kiệm, hạn chế ảnh hưởng đến môi trường vì vậy sẽ áp dụng mức thu cao để có kinh phí phòng ngừa, hạn chế các tác động xấu đối với môi trường, khắc phục ô nhiễm môi trường do hoạt động khai thác khoáng sản gây ra.
Do đó Thành phố quyết định mức thu tối đa theo khung quy định tại Nghị định 74/2011/NĐ-CP đối với tất cả các loại khoáng sản. Riêng than bùn có chất lượng thấp hơn các loại than khác nên sẽ thu ở mức tối thiếu của Nghị định 74, nhưng cũng gấp 3 lần mức thu cũ.
Đáng chú ý, Thành phố sẽ sửa đổi, bổ sung 2 khoản phí mới để phù hợp với tình hình thực tiễn và quản lý nhà nước. Theo đó, sẽ bổ sung thêm phí thăm quan khu Hoàng Thành Thăng Long, với mức 30 nghìn đồng/lượt.
Đồng thời, nhằm huy động nguồn vốn để tu bổ, sửa chữa hè, lề đường và bổ sung cho các dự án giao thông công cộng, TP sẽ điều chỉnh phí sử dụng hè, lề đường, bến bãi để trông giữ xe ô tô, trong đó sẽ được phân thành 7 vùng.