Thủ tướng Nguyễn Tấn Dũng ký Quyết định số 44/2009/QÐ-TTg ban hành phương án khẩn nguy tổng thể đối phó với hành vi can thiệp bất hợp pháp vào hoạt động hàng không dân dụng (HKDD). Theo đó, thực hiện 4 nguyên tắc tại chỗ khi xảy ra tình huống can thiệp bất hợp pháp đối với hàng không dân dụng, gồm: Phương án đối phó tại chỗ, lực lượng tại chỗ, trang thiết bị tại chỗ và hậu cần tại chỗ.
Khi có tình huống bất lợi xảy ra đối với máy bay đang bay thì cơ sở cung cấp dịch vụ không lưu là đơn vị đối phó ban đầu. Người chỉ huy cần triển khai phương án điều hành bay bị can thiệp bất hợp pháp, thực hiện các các biện pháp ưu tiên trợ giúp cho máy bay về điều hành bay đồng thời báo cáo ngay cho Hệ thống quản lý vùng trời-quản lý bay, Bộ Quốc phòng để chuẩn bị tiếp nhận chỉ huy đối phó. Người chỉ huy khẩn cấp thông báo ngay cho các Cảng hàng không Việt Nam và nước ngoài, trung tâm tìm kiếm cứu nạn liên quan chuẩn bị phương án khẩn nguy, cứu nạn.
Căn cứ vào tính chất nghiêm trọng của hành vi can thiệp bất hợp pháp, lực lượng chỉ huy, lực lượng đối phó trực tiếp tại hiện trường được quyền nổ súng cảnh cáo để uy hiếp đối tượng thực hiện hành vi can thiệp bất hợp pháp; nổ súng gây thương tích để ngăn chặn khi phần tử xấu đang đột nhập vào tàu bay, sân bay và nổ súng tiêu diệt để ngăn chặn kẻ địch, phần tử xấu đang tấn công hoặc chuẩn bị tấn công vũ trang vào máy bay.
Trường hợp máy bay không mang quốc tịch Việt Nam, thực hiện chuyến bay bị can thiệp bất hợp pháp xin hạ cánh tại cảng hàng không, sân bay Việt Nam khi được chỉ huy trưởng thực hiện phương án đối phó đồng ý. Nếu máy bay bị can thiệp bất hợp pháp đang dưới mặt đất thì không cho phép máy bay cất cánh.
Trong trường hợp cho phép, việc thương thuyết được thực hiện theo chỉ đạo chỉ huy trưởng hiện trường. Người thương thuyết phải được đào tạo hoặc có năng lực về kỹ thuật thương lượng, tâm lý tội phạm...