Tại cuộc đối thoại, TS. Nguyễn Quốc Triệu- Bộ trưởng Bộ Y tế Việt Nam chia sẻ, phòng chống tham nhũng trong ngành y tế là thách thức không nhỏ, một khó khăn rất khách quan khi mà cung ít hơn cầu, dẫn đến có mốt số tiêu cực trong quá trình KCB. Tuy nhiên, Bộ trưởng đã nhận được sự đồng thuận của khá nhiều đại biểu quốc tế khi cam kết với các nhà tài trợ sẽ đẩy mạnh công tác cải cách hành chính; tăng tính công khai minh bạch trong hoạch định chính sách, hoàn thiện cơ chế quản lý và quan tâm đến đời sống của cán bộ ngành y tế...
Thẳng thắn nhìn nhận một số tồn tại trong công tác phòng chống tham nhũng (PCTN) ở ngành y tế để khắc phục và giải quyết là cảm nhận của nhiều đaị biểu quốc tế tham dự hội nghị đối thoại lần thứ 6 với chủ đề "Tác động của tham nhũng trong ngành y tế tại Việt Nam: Làm thế nào để tăng cường tính minh bạch và trách nhiệm giải trình". Trong thời gian qua, ngành y tế đã nỗ lực triển khai thực hiện công tác PCTN thông qua các việc cụ thể như: thành lập BCĐ PCTN ngành y tế, các đơn vị trong ngành đã triển khai sâu rộng và quán triệt thực hiện các nội dung của Luật PCTN... Ban hành và triển khai quy tắc ứng xử, quy tắc đạo đức nghề nghiệp đối với cán bộ y tế; đồng thời tích cực thực hiện công tác cải cách hành chính không chỉ ở các cơ quan quản lý trực thuộc Bộ mà còn tại tất cả hệ thống KCB thông qua việc ứng dụng công nghệ thông tin trong cấp phép, đăng ký hồ sơ, đăng ký KCB và thanh toán viện phí, BHYT... Ngoài ra, ngành y tế cũng đã nghiêm túc xử lý một số vụ việc của ngành sau khi có kết luận của cơ quan điều tra, cụ thể như: Công tác cổ phần hóa của Công ty Dược phẩm TW 2, việc mua sắm trang thiết bị của 5 đơn vị hay vụ rút ruột BHYT tại BV Chợ Rẫy...
Mặc dù vậy, đây đó trong ngành cũng vẫn còn một số hạt sạn khi thực hiện PCTN thể hiện qua việc, một số cơ sở KCB chưa thực hiện đúng các chế độ thanh toán chi phí điều trị BHYT, có hiện tượng lợi dụng chính sách miễn, giảm viện phí cho người nghèo, trẻ dưới 6 tuổi để chi sai chế độ. Có hiện tượng thầy thuốc, cán bộ y tế lấy thuốc, vật tư của nhà nước đem ra thị trường bán chia nhau tiền. Một số bác sĩ, cán bộ y tế đã lợi dụng quyền hạn có biểu hiện vòi vĩnh tiền của người bệnh. Có trường hợp lôi kéo bệnh nhân ở bệnh viện công đến cơ sở khám tư. Công tác đấu thầu thuốc trong bệnh viện còn lộn xộn...