Theo Sở GTVT Yên Bái, do ảnh hưởng của hoàn lưu bão số 3 (bão Yagi) gây mưa lớn kéo dài, kết hợp với mưa lũ ở thượng nguồn đã làm nước sông Hồng, khu vực qua cầu Yên Bái lên cao hơn báo động 3 là 3,73m, có nhiều rác, cây trôi, làm trôi 2 xe kiểm tra cầu.
Ngoài ra, khi mực nước sông Hồng dâng lên gần hệ giàn thép (khoảng 8h ngày 10/9), có một tàu hút cát trôi tự do từ phía thượng nguồn sông Hồng đã va vào trụ, dầm cầu Yên Bái, làm ảnh hưởng đến chất lượng, an toàn công trình. Việc này cũng tác động đến hệ thống kết cấu, liên kết công trình.
Sở GTVT tỉnh Yên Bái sau đó đã phối hợp Trung tâm kỹ thuật đường bộ để kiểm tra tại các vị trí mố, trụ của cầu Yên Bái.
Sau khi cấm cầu, phương tiện sẽ di chuyển qua cầu Bách Lẫm, cầu Tuần Quán và các cầu khác trên địa bàn TP. Yên Bái.