Chiều 18/5, TP.HCM ghi nhận 2 trường hợp lây nhiễm trong cộng đồng trong đó có BN4514 cư ngụ tại chung cư Sunview Town, TP Thủ Đức. Nhóm nghiên cứu COVID-19 của BV Bệnh Nhiệt Đới và Đơn vị Nghiên cứu Lâm Sàng Đại Học Oxford đã thực hiện phân tích giải mã gene đối với bộ gene SARS-CoV-2 thu được từ bệnh nhân BN4514.
Kết quả giải trình tự gene BN4514 cư ngụ tại TP Thủ Đức cho thấy bệnh nhân nhiễm SARS-CoV-2 biến chủng Ấn Độ B.1.617.2.
Kết quả định danh bằng phần mềm Pangolin cho thấy bộ gene thu được thuộc biến chủng B.1.617.2.
Cụ thể, kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE cho thấy, bộ gene mang 6 đột biến thay đổi aminoacid tiêu biểu (T19R, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N) và một đột biến đứt đoạn (156-158) trên vùng protein gai của biến chủng B.1.617.2. Qua đó kết luận BN4514 nhiễm SARS-CoV-2 biến chủng Ấn Độ B.1.617.2, cùng chủng đang lưu hành hiện nay tại các tỉnh phía Bắc Việt Nam.
Liên quan đến BN 4514 còn có trường hợp nhiễm đã được xác định (đang chờ Bộ Y tế công bố) cư ngụ tại quận 7. Hai người cùng làm việc chung trong một đội 8 người tại một phòng làm việc trong công ty Grove, đường Pasteur, ở quận 3. Bệnh nhân cư ngụ tại Quận 7, theo lời khai, đã rời khỏi TP.HCM từ ngày 24/4 đi Hải Phòng và trở về thành phố ngày 5/5 trên chuyến bay đi VN1179 từ Hải Phòng đến TP.HCM.
Bệnh nhân có dấu hiệu sốt, tự mua thuốc uống vào ngày 8/5. Căn cứ kết quả dấu hiệu lâm sàng, yếu tố dịch tễ và xét nghiệm thì có nhiều chứng cứ cho thấy BN4514 bị lây từ bệnh nhân cư ngụ tại Quận 7. Tuy nhiên, đối với trường hợp bệnh nhân ở quận 7, do tình trạng bệnh đang quá trình hồi phục nên rất khó để thực hiện giải trình tự gene. Nhưng nhóm nghiên cứu sẽ cố gắng hết sức để có thể giải trình tự bộ gen của SARS-CoV trên bệnh nhân này.