Theo Bộ GD&ĐT, kết thúc đợt 1, kỳ thi tuyển sinh ĐH-CĐ năm 2011, cả nước có 126 thí sinh bị xử lý kỷ luật, trong đó có 80 thí sinh bị đình chỉ thi, 33 thí sinh bị khiển trách và 10 thí sinh bị cảnh cáo.
Theo Thứ trưởng Bộ GD&ĐT Bùi Văn Ga, lần đầu tiên sau 10 năm tổ chức thi tuyển sinh theo phương thức “ba chung”, Bộ GD&ĐT phải dùng đến đề thi dự bị để giải quyết sự cố giám thị ký nhầm vào ô giám khảo và phát nhầm mã đề thi tại Trường Sĩ quan chỉ huy kỹ thuật thông tin và ĐH Giao thông vận tải. Trong cả hai sự cố, Ban chỉ đạo tuyển sinh đều đã có chỉ đạo và hướng giải quyết kịp thời để bảo đảm quyền lợi của thí sinh. Bộ GD&ĐT cũng đã yêu cầu các hội đồng thi đợt 2 diễn ra vào ngày 9 - 10/7 phải kịp thời chấn chỉnh các khâu của công tác chuẩn bị, công tác coi thi để không xảy ra những sự cố đáng tiếc như trên.